MRT-Bildharmonisierung verstehen

Die Magnetresonanztomographie (MRT) ist eine wertvolle und vielseitige medizinische Bildgebungsmethode, zeigt jedoch häufig heterogene Bildqualität über verschiedene Protokolle und Scanner hinweg.  

Bei der Datenanalyse stellen wir regelmäßig Bildabweichungen fest, insbesondere bei der Verarbeitung realer Daten aus mehreren Bildgebungszentren. Diese Abweichungen können auf unterschiedliche Scannerhersteller, Scannermodelle oder Erfassungsprotokolle zurückzuführen sein. Dies führt zu erheblichen Unterschieden in den Bildintensitätswerten. Solche Abweichungen stellen erhebliche Herausforderungen bei der Erstellung universell anwendbarer und zuverlässiger Modelle dar.1Sie wirken sich auch auf die Reproduzierbarkeit von quantitativen Bildgebungs-Biomarkern und Radiomics-Funktionen aus2, entscheidend für die Entwicklung klinischer Entscheidungsunterstützungssysteme. Diese Variabilität ist besonders bei Magnetresonanzbildern (MR) ausgeprägt, da die Intensitäten von MR-Bildern im Gegensatz zu Computertomographie-Scans (CT), bei denen die Intensitätswerte auf Hounsfield-Einheiten standardisiert sind (die ebenfalls einen gewissen Grad an Harmonisierung erfordern), nicht auf eine Standardmaßeinheit normiert sind. As kann sein beobachtet in Figure 1, HERRI scannt erworben mit unterschiedlichen Echozeiten (TE) und Wiederholzeiten (TR) führen zu Unterschieden in der Bildintensität. 

MRT-Bildharmonisierung
Abbildung 1. T2w-MRT der Prostata mit unterschiedlichen TR- und TE-Werten.

 

Bemühungen zur Standardisierung von MRT-Scans stoßen oft auf Herausforderungen aufgrund von Variationen in Hardware-, Software- oder Scaneinstellungen was die Genauigkeit beeinträchtigen kann von quantitativen Ergebnissen. Dieses Problem wird besonders wichtig, wenn fortschrittliche Technologien wie künstliche Intelligenz (KI) oder digitale Analysemethoden verwendet werden. Bei Studien an mehreren Standorten oder über einen längeren Zeitraum, bei denen Konsistenz von entscheidender Bedeutung ist, können diese Abweichungen die Zuverlässigkeit der Ergebnisse erheblich beeinträchtigen. Daher ist die Bewältigung dieser Herausforderungen von entscheidender Bedeutung, um die Qualität und Konsistenz der MRT-Daten bei solchen Untersuchungen sicherzustellen.  

 

Von traditionellen Methoden zu Deep-Learning-Techniken zur Bewältigung von Abweichungen in der medizinischen Bildgebung

Herkömmliche Computer-Vision-Techniken verwenden häufig Methoden zum Normalisieren, Zentrieren und Standardisieren von Bildintensitäten. Diese Techniken skalieren die Intensitätswerte normalerweise auf einen gemeinsamen Bereich, stellen die mittlere Intensität auf Null ein und stellen die Einheitsvarianz sicher. Diese herkömmlichen Methoden haben jedoch noch keine robuste Generalisierungsleistung in der medizinischen Bildgebung erreicht, vor allem bei der Arbeit mit Daten aus verschiedenen Bildgebungszentren. 

Um diese Herausforderungen zu bewältigen, müssen Daten aus mehreren Bildgebungszentren in den Trainingsprozess einbezogen werden. Das Sammeln derart unterschiedlicher Daten ist jedoch eine Herausforderung, da umfangreiche Informationen aus diesen Zentren erforderlich sind. Während herkömmliche Rauschunterdrückungsalgorithmen wie Diffusion Anisotropic, N4 oder Bias-Field-Korrekturfilter eingesetzt wurden, um die Bildqualität zu verbessern,3,4,5, ihre Fähigkeit zur Verallgemeinerung auf verschiedene Rauschquellen und der damit verbundene erhebliche Rechenaufwand schränken ihre praktische Anwendung im klinischen Umfeld ein. 

Um die Einschränkungen traditioneller Methoden zu überwinden, ist die Erforschung von Deep-Learning-Techniken zur Handhabung von Variationen in der medizinischen Bildgebung von entscheidender Bedeutung. Diese Techniken konzentrieren sich auf die Entwicklung von Bildstandardisierungsmethoden, die in der Lage sind, die in diesem Bereich beobachteten Heterogenitäten zu bewältigen. Bildgenerierungstechnik, die neue Bilder erstellt, normalerweise basierend auf vorhandenen6 sind in der medizinischen Bildgebung aufgrund der Generalisierungsprobleme, mit denen KI-basierte Lösungen konfrontiert sind, zunehmend relevant geworden.  

In den letzten Jahren wurden auf diesem Gebiet spannende Fortschritte erzielt, darunter bemerkenswerte Erfolge bei Aufgaben wie der Bildretuschierung (Ausfüllen fehlender Bildteile).7, Verbesserung der Bildqualität oder Auflösung8,9, Lärmminderung10,11,12und Stilübertragung mit Techniken wie Cycle-GAN13,14. 

 

Quibims Methodik 

In dieser Hinsicht hat Quibim führte eine neuartige Methodik ein, die selbstüberwachte Techniken nutzt und nutzt den Frequenzbereich auf einzigartige Weise, zur synthetischen Erzeugung von Kontrastvariationen aus originalen, hochwertigen und homogenen Bildern die als Referenzgruppe fungieren. Dieser Referenz Gruppe wieder vereint die vor allem warme erwünscht Image -Funktion Darstellungen zu welche die Ruhe of die Bildern werden wir imitieren, und is einzige zusammengesetzt by die beste 13 Fälle, as Tausende of Änderungen Diese erhalten für jeder Häuser. Bei diesem Ansatz wird ein Convolutional Neural Network (CNN) trainiert, um diese unterschiedlichen generierten Kontraste auf dieselbe Referenzgruppe zu standardisieren. Diese einfache, aber innovative Lösung kann verallgemeinert werden effektiv, zumal das Netzwerk zu Lernzwecken einer großen Bandbreite an Kontraständerungen ausgesetzt wird. 

MRT-Bildharmonisierung
Teilmenge der synthetischen Variationen (obere Reihe), die durch Änderung des Frequenzbereichs (untere Reihe) erzeugt wurden.

 

Figure 2 zeigt ein Beispiel für alUntersuchungen an einer Probe aus dem Referenzmaterial GruppeDas Referenzbild wird in den Frequenzbereich transformiert wo Tausende von Änderungen vorgenommen werden (untere Reihe). Schließlich werden diese veränderten Frequenzbereichsbilder zurück in den Bildbereich transformiert, wo Die synthetischen Veränderungen der Bildintensitäten werden beobachtet (oberste Reihe).

Die Arbeit im Frequenzbereich war der Schlüsselaspekt dieser Methodik, Daten in Der K-Raum ist ein grundlegendes Konzept in der MRT und stellt die Rohdaten dar, die während eines MRT-Scans erfasst werden. Daten im K-Raum, die durch magnetische Gradienten und Hochfrequenzimpulse gewonnen werden, werden durch Fourier-Transformation vom Frequenzbereich in den Bildgebungsbereich transformiert, wodurch ein interpretierbares Bild entsteht. Der K-Raum kann als Matrix mit Punkten konzipiert werden, die bestimmte Frequenzen und Phasen des Signals darstellen, wobei das Zentrum niederfrequente Komponenten erfasst und die Peripherie hochfrequente Komponenten erfasst. Demnach ist es möglich, Änderungen vorzunehmen in subtile Merkmale wie Kontrast or Helligkeit des Bildes, während der Inhalt der Originalprobe erhalten bleibt. ODie ursprünglichen K-Raum-Rohdaten sind nicht mehr verfügbar, wenn das Bild das PACS erreicht, aber es ist möglich, auf den Frequenzbereich zuzugreifen, indem man die Fourier-Transformation durchführt. 

Bei diesem Ansatz wird ein Convolutional Neural Network (CNN) trainiert, um diese unterschiedlichen generierten Kontraste auf dieselbe Referenzgruppe zu standardisieren. Diese einfache, aber innovative Lösung kann verallgemeinert werden effektiv, zumal das Netzwerk zu Lernzwecken einer breiten Palette von Kontraständerungen ausgesetzt wird, ermöglicht.gepaartes Training, bei dem jede Probe mit ihrem veränderten Gegenstück abgeglichen wird, wodurch die Robustheit und Anpassungsfähigkeit des Modells in verschiedenen medizinischen Bildgebungsszenarien verbessert wird. 

Abbildung 3 zeigt einige Ergebnisse unserer innovativen Lösung, wir können sehen, wie wir Standardisierung der Bildintensitäten über einen Datensatz mit einer heterogenen MRI-Dynamikic-Bereich. 

MRT-Bildharmonisierung
Abbildung 3. Beispiel für Originalfälle (links) und nach Verwendung des Harmonisierungstools Quibim (rechts).

 

Der Ansatz von Quibim stellt einen bedeutenden Fortschritt bei der Überwindung der langjährigen Herausforderungen der Bildstandardisierung in der medizinischen Bildgebung dar und trägt zur Entwicklung zuverlässigerer und genauerer Diagnoseinstrumente bei. 

 

Referenzen

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  2. Mi H, Yuan M, Suo S, Cheng J, Li S, Duan S, Lu Q. Einfluss unterschiedlicher Scanner und Erfassungsparameter auf die Robustheit von MR-Radiomics-Funktionen basierend auf dem Gebärmutterhals von Frauen. Sci Rep. 2020 Nov 23;10(1):20407. doi: 10.1038/s41598-020-76989-0. PMID: 33230228; PMCID: PMC7684312. 
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  5. SONG, Shuang; ZHENG, Yuanjie; HE, Yunlong. Eine Übersicht über Methoden zur Bias-Korrektur in medizinischen Bildern. Biomedical Engineering Review, [Sl], v. 1, n. 1, sep. 2017. ISSN 2375-9151.  
  6. Roberto Gozalo-Brizuela, Eduardo C. Garrido-Merchán. Eine Umfrage zu generativen KI-Anwendungen, möglicherweise. 2023 
  7. Hanyu Xiang, Qin Zou, Muhammad Ali Nawaz, Xianfeng Huang, Fan Zhang, Hongkai Yu, Deep Learning für Bildretuschierung: Eine Studie, Mustererkennung, Band 134, 2023,109046, 0031, ISSN 3203 10.1016, https://doi.org/2022.109046/j.patcog.XNUMX. 
  8. Yamashita, Koki & Markov, Konstantin. (2020). Medizinische Bildverbesserung mit Super-Resolution-Methoden. 10.1007/978-3-030-50426-7_37. 
  9. Yuan Ma, Kewen Liu, Hongxia Xiong, Panpan Fang, Xiaojun Li, Yalei Chen, Zejun Yan, Zhijun Zhou, Chaoyang Liu, Medizinische Bild-Superauflösung unter Verwendung eines relativistischen durchschnittlichen generativen kontradiktorischen Netzwerks, Nukleare Instrumente und Methoden in der Physikforschung, Abschnitt A: Beschleuniger, Spektrometer, Detektoren und zugehörige Ausrüstung, Band 992, 2021, 165053, ISSN 0168-9002, https://doi.org/10.1016/j.nima.2021.165053. 
  10. Kaur P, Singh G, Kaur P. Eine Übersicht über die Rauschunterdrückung medizinischer Bilder mittels maschinellem Lernen Ansätze. Curr Med Imaging Rev. 2018 Okt;14(5):675-685. doi: 10.2174/1573405613666170428154156. PMID: 30532667; PMCID: PMC6225344. 
  11. Arshaghi, Ali & Ashourian, Mohsen & Ghabeli, Leila. (2020). Rauschunterdrückung bei medizinischen Bildern mithilfe von maschinellem Lernen und Deep Learning-Ansätzen: Eine Untersuchung. Current Medical Imaging, früher Current Medical Imaging Reviews. 16.10.2174/1573405616666201118122908. 
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  14. Modanwal, Gourav & Vellal, Adithya & Buda, Mateusz & Mazurowski, Maciej. (2020). MRT-Bildharmonisierung mithilfe eines zykluskonsistenten generativen kontradiktorischen Netzwerks. 36. 10.1117/12.2551301. 

 

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